かわぐちかいじの同名マンガを映画化した「沈黙の艦隊」の続編にあたる物語が後半で紡がれる。

一个关系不睦却强大无比的忍者家庭在退休多年后，为了反击一连串日益逼近的威胁，开始重操旧业执行起地下任务。